很高兴能够回答楼主的问题，在动漫《fate stay night》中，远坂凛知晓红A就是卫宫士郎，是在圣杯战争进行到后期的时候，远坂凛在从卫宫士郎那发现了红A“已经交给她的项链”，才确认了两人之间的端倪。在之前相处的时间中，远坂凛根本没有发现红A就是卫宫士郎这件事情。就算有朝这方面思考的苗头，也不敢进行确认。明明卫宫士郎与红A的相似度已经如此明显，远坂凛却还是看不出，她为何如此粗心？

首先观众们会产生这种想法，是由于我们处在上帝视角，并且用上帝视角带入了远坂凛的角度。虽然远坂凛是红A的御主，可以间接观测到红A扭曲的梦境，可她当时仅仅知道红A一人背负了“扭曲的罪恶”而已。在动漫设定中，卫宫士郎是远坂凛邻班同学，在经历圣杯战争前两人交往并不深。远坂凛只是知道隔壁班级有着一位敢于挑战困难，自己对其有好感的男生，卫宫士郎则知道隔壁班级有个容貌，成绩，体育都是优等的校花，两人的关系仅此而已。

远坂凛在对卫宫士郎有足够了解之前，根本不知道他那“扭曲的正义”，更别提将卫宫士郎的内在与自己的从者红A的内在联系起来，毕竟用正常人的思维来看，谁能够猜到隔壁班级的一名男同学，与自己召唤出的从者是同一人呢？至于外貌方面。经历了核电站事故和英灵化的红A，外貌方面与卫宫士郎早已大相径庭，两者的相似度实际上已经很低了。

实际上作为魔术天才的远坂凛，她不仅不粗心，观察力还远远胜于常人。比如说她在初次见到卫宫士郎的投影魔术时就察觉出了端倪，只是“红A就是未来的卫宫士郎”这件事实在是难以接受，所以在确凿的证据“宝石项链”出现之前，远坂凛一直都不敢确认。站在上帝视角带入动漫角色，自然会觉得远坂凛不置可否，连这么浅显的事实都看不出来。

如果站在远坂凛的角度看，根据她所能获取到的信息与逻辑思维来进行分析，却会发现这一切都是正常现象。毕竟在圣杯战争开始之前她对于卫宫士郎的了解并不深。