侯耀文是因为突发心源性心脏病而死。 2007年6月23日，因突发心源性心脏病于北京昌平区玫瑰园别墅家中病逝，享年59岁。 2007年7月7日上午8时，侯耀文先生追悼会及遗体告别仪式在八宝山革命公墓第一告别室举行。他的亲属、弟子以及曲艺界、戏曲届、影视界等友人纷纷赶来吊唁。上万名群众从凌晨起便聚集于此，排队等候与侯耀文见上最后一面。