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苏州大学研究生院，2012年4月7日正式挂牌成立，这是教育部宣布取消研究生院设置行政审批之后由高校自主设立的首个研究生院。

在中国高等教育史上，苏州大学前身东吴大学最早开展研究生教育并授予硕士学位。

截止至2018年12月，苏州大学设有51个一级学科硕士点，24个专业学位硕士点；28个一级学科博士点，1个专业学位博士点，29个博士后流动站；有全日制硕士生11959人，在职专业学位硕士1726人，全日制博士生1788人，临床博士2146人。