红谷滩古称鸿鹄滩，因是水鸟栖息之地而得名，后取谐音演化为红谷滩沿用到现今。

20世纪，红谷滩绝大部分为沙滩、滩涂。

1998年至2000年，为酝酿、决策和抽沙造地阶段

2000年7月11日，正式启动红谷滩中心区4.28平方千米的开发建设。

2001年底，南昌市行政中心竣工，市委、市人大、市政府、市政协、市纪委等部分党政机关迁入红谷滩办公。

2000年2月，南昌市市委、市政府下发《关于全面开发建设红谷滩新区的初步实施方案》，成立红谷滩新区开发建设总指挥部，下设综合办公室。

2002年4月9日，南昌市委、市政府正式批复成立红谷滩新区管委会，并于5月15日挂牌运行，将红谷滩新区区域面积扩大到50平方千米。

2009年，江西省编办批准红谷滩新区管委会为副厅级建制。

2019年11月，国务院批复江西省人民政府：设立红谷滩区，以东湖区沙井街道、卫东街道和新建区生米镇的行政区域为红谷滩区的行政区域（国函2019 105号）。

2020年6月28日，南昌市举行红谷滩区挂牌仪式，红谷滩区正式成为南昌的市辖区。南昌市东湖沙井街道、卫东街道和新建区生米镇划归红谷滩区管辖，成为红谷滩区的行政区域。

2022年1月17日，南昌市红谷滩区人民政府官网发布了公告，撤销红谷滩区生米镇设立红谷滩区生米街道。

2022年2月1日，南昌市新建区厚田乡划归南昌市红谷滩区管辖。